Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms