Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF4Q9BXJ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms