Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYCP2Q9BX26 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP2Q9BX26 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms