Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBB2BQ9BVA1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms