Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS4Q9BT78 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COPS4Q9BT78 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms