Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC39A3Q9BRY0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms