Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TM2D3Q9BRN9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TM2D3Q9BRN9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TM2D3Q9BRN9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TM2D3Q9BRN9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TM2D3Q9BRN9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TM2D3Q9BRN9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TM2D3Q9BRN9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TM2D3Q9BRN9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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