Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC38A2Q96QD8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A2Q96QD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms