Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms