Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOLD1Q96LR9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms