Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK3Q96L96 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK3Q96L96 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms