Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPGRIP1Q96KN7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPGRIP1Q96KN7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms