Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAMP1Q96JM3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms