Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms