Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CARD19-202ENST00000466409 2291 ntTSL 1 (best)22.37■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMBIM1-211ENST00000440422 659 ntTSL 522.32■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KMT5B-207ENST00000427752 2475 ntTSL 222.29■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BTBD19-209ENST00000495433 934 ntTSL 322.23■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CARD19-204ENST00000468781 660 ntTSL 222.2■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CARD19-203ENST00000466929 506 ntTSL 322.2■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HIBCH-206ENST00000409934 826 ntTSL 322.08■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MPRIP-210ENST00000577514 513 ntTSL 522.06■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PTP4A1-203ENST00000473334 638 ntTSL 322.02■■□□□ 1.125e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ST3GAL4-216ENST00000533826 1037 ntTSL 322■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 OIP5-AS1-205ENST00000558945 1269 ntTSL 521.99■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 OIP5-AS1-206ENST00000559368 642 ntTSL 321.99■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC6A9-209ENST00000492434 592 ntTSL 321.74■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCUN1D5-204ENST00000527576 790 ntTSL 521.65■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PTPRK-222ENST00000532751 563 ntTSL 421.63■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AKTIP-211ENST00000568596 959 ntTSL 221.61■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BTBD19-207ENST00000485668 2659 ntTSL 221.61■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-215ENST00000481552 504 ntTSL 521.6■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CARD19-208ENST00000495641 926 ntTSL 221.57■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NFKBID-204ENST00000586361 1399 ntTSL 521.57■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NFRKB-207ENST00000530278 895 ntTSL 321.48■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TNFRSF10B-207ENST00000523504 1464 ntTSL 221.38■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAPOLA-207ENST00000554130 848 ntTSL 521.36■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RARRES2-204ENST00000478771 1907 ntTSL 221.22■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHYKPL-209ENST00000489262 2780 ntTSL 221.11■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ZCCHC2-202ENST00000585873 5652 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 COG8-202ENST00000562595 2262 ntTSL 521.02■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HCFC1R1-205ENST00000573842 495 ntTSL 220.84■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-212ENST00000475765 898 ntTSL 220.82■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EHMT1-246ENST00000637748 2006 ntTSL 520.82■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RNF4-205ENST00000504224 560 ntTSL 420.78■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM56-203ENST00000456991 992 ntTSL 320.76■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ST3GAL4-214ENST00000531217 1745 ntTSL 520.75■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LPCAT3-204ENST00000536797 1412 ntTSL 220.69■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AKTIP-206ENST00000564497 541 ntTSL 520.66■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HCFC1R1-209ENST00000576921 1199 ntTSL 1 (best)20.65■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CNEP1R1-201ENST00000389134 579 ntTSL 320.64■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TCHP-206ENST00000544838 2077 ntTSL 220.55■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CYLD-215ENST00000569681 777 ntTSL 220.51■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPM1H-203ENST00000548414 522 ntTSL 320.5■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 YTHDF3-206ENST00000612880 593 ntTSL 220.4■□□□□ 0.865e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 YTHDF3-204ENST00000522282 445 ntTSL 320.4■□□□□ 0.865e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HCFC1R1-208ENST00000575214 1365 ntTSL 220.34■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 54.9
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