Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST2Q8NFU1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST2Q8NFU1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms