Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms