Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF554Q86TJ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms