Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PREX2Q70Z35 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PREX2Q70Z35 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PREX2Q70Z35 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms