Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRIG3Q6UXM1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms