Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms