Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FFAR4Q5NUL3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FFAR4Q5NUL3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms