Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGAP29Q52LW3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms