Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RTL8BQ17RB0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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