Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN1Q16658 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN1Q16658 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms