Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NREPQ16612 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NREPQ16612 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NREPQ16612 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
NREPQ16612 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
NREPQ16612 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NREPQ16612 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
NREPQ16612 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NREPQ16612 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
NREPQ16612 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
NREPQ16612 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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