Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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