Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGN3Q15651 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGN3Q15651 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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