Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS1Q14691 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GINS1Q14691 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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