Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP1B1Q10567 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP1B1Q10567 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms