Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms