Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPCAP84074 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPCAP84074 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPCAP84074 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPCAP84074 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPCAP84074 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPCAP84074 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPCAP84074 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPCAP84074 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms