Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SUMO1P63165 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms