Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms