Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN18P56856 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms