Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPT1P50897 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPT1P50897 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPT1P50897 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms