Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ACTN2P35609 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms