Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC4P35249 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC4P35249 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC4P35249 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC4P35249 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC4P35249 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC4P35249 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC4P35249 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC4P35249 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC4P35249 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC4P35249 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC4P35249 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC4P35249 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC4P35249 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC4P35249 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC4P35249 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC4P35249 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC4P35249 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC4P35249 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC4P35249 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC4P35249 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC4P35249 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFC4P35249 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFC4P35249 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFC4P35249 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFC4P35249 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFC4P35249 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFC4P35249 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC4P35249 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC4P35249 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC4P35249 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC4P35249 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC4P35249 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC4P35249 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC4P35249 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC4P35249 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms