Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms