Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GADD45AP24522 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms