Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA6P17066 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA6P17066 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms