Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSPP15924 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSPP15924 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DSPP15924 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSPP15924 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSPP15924 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSPP15924 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSPP15924 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DSPP15924 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DSPP15924 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSPP15924 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSPP15924 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DSPP15924 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSPP15924 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSPP15924 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSPP15924 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSPP15924 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSPP15924 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSPP15924 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DSPP15924 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSPP15924 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms