Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BMP3P12645 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BMP3P12645 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BMP3P12645 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BMP3P12645 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMP3P12645 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMP3P12645 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMP3P12645 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BMP3P12645 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms