Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CXCL10P02778 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL10P02778 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms