Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP4K4O95819 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms