Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3O43889 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3O43889 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3O43889 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3O43889 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3O43889 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3O43889 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3O43889 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3O43889 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms