Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNMO15061 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNMO15061 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNMO15061 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYNMO15061 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYNMO15061 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNMO15061 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNMO15061 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNMO15061 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNMO15061 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNMO15061 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNMO15061 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNMO15061 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNMO15061 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNMO15061 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNMO15061 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNMO15061 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNMO15061 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNMO15061 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNMO15061 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNMO15061 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNMO15061 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNMO15061 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNMO15061 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYNMO15061 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms