Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD1AO15047 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms