Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD8O14715 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD8O14715 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms