Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBAG9O00559 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms